Osnutak i gradnja
Dana 28. svibnja 1505. opservantski vikar Provincije sv. Jeronima fra Franjo de Dragonibus iz Kotora i fra Augustin iz Zadra izjavljuju pred zamjenikom osorskoga biskupa da osorski plemić Colon de Drosa (Dragozetić) želi sagraditi Maloj braći samostan u Nerezinama, dva kilometra južno od Osora.
Samostan je podignut uz more, u obliku klaustralnog zdanja, jednostavnog i bez ornamentike. Crkva, građena uporedo sa samostanom, završena je još za života donatora. On ostavlja četrdeset dukata za sliku velikog oltara, koja prikazuje sv. Franju u ekstazi.
U crkvi se nalaze i dva pobočna oltara:
-
oltara sv. Antuna, sa slikom koju je narod osobito štovao,
-
oltara Gospe od Milosti, sa slikom u mramornoj niši (vjerojatno grčke provenijencije, donesena iz Bosne) te slikom venecijanskog majstora Girolama da Santa Croce.
Četvrtasti trokatni zvonik, prepoznatljiv po kupoli od sive opeke, građen je od 1590. do 1604. godine. Pred crkvom se prostire mjesno groblje, u skladu s dugom tradicijom franjevačkih samostana kao mjesta pobožnosti i okupljanja naroda.
Povijesne mijene
Nakon Rapalskog ugovora (1920.), Lošinj pripada Italiji, a samostan odlukom vrhovne uprave Reda prelazi u ruke Mletačke provincije sv. Antuna.
Mirovnim ugovorom u Parizu (1947.) Lošinj je vraćen Hrvatskoj, a dekretom Generalnog definitorija (10. prosinca 1948.) samostan je vraćen Provinciji sv. Jeronima.
U razdoblju nakon Drugoga svjetskog rata, zbog nedostatka svećenika, braća provincije preuzimaju službu u mjesnoj župi i okolnim župama Sv. Jakova i Osora. Kasnije, kad su župe popunjene dijecezanskim klerom, franjevci ostaju na raspolaganju za ispomoć i bogoslužje u samostanskoj crkvi.
Društvena i kulturna uloga
Dio prizemnih prostorija samostana ustupljen je Caritasu iz Zagreba za odmor djece i invalida, zbog čega je provedeno i djelomično preuređenje zdanja. Crkva je temeljito obnovljena i dovedena u dostojno stanje za bogoslužje.
Samostanska knjižnica, mješovitog sadržaja (pretežno teološkog), osobito je vrijedna zbog ranog tiska i sedam inkunabula. Dio knjižnice i arhiva kasnije je prenesen u Rovinj i Zadar radi očuvanja.
Današnji status
Samostan u Nerezinama registriran je kao spomenik kulture u Zavodu za zaštitu spomenika kulture u Rijeci, te čuva ulogu svjedočanstva franjevačke prisutnosti i djelovanja na otoku Lošinju.
Važnija slavlja tijekom godine:
sv. Antun Padovanski (13.VI.), Porcijunkula (2.VIII.) i sv. Franjo (4.X.).